法華宗（本門流）宗務院とは、全国の法華宗寺院教会が運営していく上で必要な諸事務を担当する機関です。また宗門の運営を統括し、当宗の目的を実現するための実質的業務も行っております。これらを実行するため教学部、総務部、布教部、財務部及び企画部が設けられています。また、宗内外へ布教するために無上道・教化センター・菩薩行研究所の事務所もあり、諸々の宗門刊行物も取り扱っております。